NHẬN DIỆN VÀ XÁC ĐỊNH MỐI QUAN HỆ DI TRUYỀN CỦA HAI CÁ THỂ QUÝT ĐƯỜNG KHÔNG HỘT ĐƯỢC PHÁT HIỆN Ở ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG BẰNG DẤU PHÂN TỬ DNA

Nguyễn Bá Phú * , Nguyễn Bảo Vệ , Trần Nhân Dũng và Bùi Thị Cẩm Hường

* Tác giả liên hệ (nbphu@ctu.edu.vn)

Article Sidebar

Full Text: PDF

Ngày nhận bài: 20-04-2021
Ngày duyệt đăng: 03-06-2022
Ngày xuất bản: 01-05-2011
Title:
Lượt xem
61
Downloads
36
Trích dẫn
Phú, N. B., Vệ, N. B., Dũng, T. N., & Hường, B. T. C. (2011). NHẬN DIỆN VÀ XÁC ĐỊNH MỐI QUAN HỆ DI TRUYỀN CỦA HAI CÁ THỂ QUÝT ĐƯỜNG KHÔNG HỘT ĐƯỢC PHÁT HIỆN Ở ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG BẰNG DẤU PHÂN TỬ DNA. Tạp chí Khoa học Đại học Cần Thơ, (20a), 108-118. Truy vấn từ https://ctujsvn.ctu.edu.vn/index.php/ctujsvn/article/view/1101
Số báo
Số. 20a (2011)
Chuyên mục
Công nghệ

Abstract

To understand about genetic traits of the two seedless Duong tangerine trees discovered in Mekong Delta (Nguyen Bao Ve et al., 2007), this study was carried out: (i) to find a suitable markers to identify and (ii) to determine the genetic relationship between two seedless Duong tangerine trees and with seedy Duong tangerine trees. The sequence analysis results from ITS region and MatK gene showed that they were similar in seedless and seedy Duong tangerine trees. By RAPD using seven primers (A13, OPH13, SO15, SN20, A02, OPH18 and SN06), there were different bands presented in gel, these makers to identify seedless and seedy Duong tangerine trees, SO15 and A13 primers might use to determine between seedless and seedy Duong tangerine trees, SN06 and SN20 primers might use to distinguish two seedless Duong tangerine trees and seedy Duong tangerine tree; therefore, the genetic relationship between two seedless trees was tightly close (0,92) and closely with seedy tree (0,87).          
Keywords: molecular markers, primer, seedless, Citrus, Duong tangerine, Citrus reticulata

Tóm tắt

Để có thông tin về đặc điểm di truyền của hai cây quýt Đường không hột được phát hiện ở Đồng Bằng Sông Cửu Long (Nguyễn Bảo Vệ et al., 2007), đề tài được thực hiện nhằm: (i) tìm phương pháp đánh dấu phân tử để nhận diện và (ii) xác định mối quan hệ di truyền giữa hai cây quýt Đường không hột với nhau và với cây quýt Đường có hột. Kết quả giải trình tự các nucleotide vùng ITS và gen matK cho thấy giữa hai cây quýt Đường không hột là giống nhau và không khác biệt với cây quýt Đường có hột. Bằng kỹ thuật RAPD với 7 mồi (A13, OPH13, SO15, SN20, A02, OPH18 và SN06), đã ghi nhận có những sai khác về phổ băng DNA, đây là dấu phân tử để nhận diện hai dòng quýt Đường không hột, mồi SO15 và A13 có thể phân biệt được hai cây quýt Đường không hột với cây quýt Đường có hột, mồi SN06 và SN20 có thể phân biệt được hai cây quýt Đường không hột với nhau và với cây quýt Đường có hột, kết quả phân tích quan hệ di truyền cho phép kết luận hai cây quýt Đường không hột có mối quan hệ gần gũi với nhau (0,92) và gần với quýt Đường có hột (0,87).
Từ khóa: Random Amplification of Polymorphic DNA (RAPD), marker phân tử, mồi, không hột, cam quýt, quýt Đường, Citrus reticulata

Article Details

Tài liệu tham khảo

Andrade-Rodríguez, M., A. Villegas-Monter, G. Carrillo-Castaneda, A. García-Velásquez (2004), Polyembryony and identification of volkamerian lemon zygotic and nucellar seedlings using RAPD, Pesq. Agropec. Bra, 39, 551- 559.

Coletta-Filho, H.D., M.A. Machado, M.L.P.N. Targon, M.C.P.Q.D.G. Moreira and J. Pompeu Jr. (1998), Analysis of the genetic diversity among mandarins (Citrus spp.) using RAPD markers. Euphytica, 102(1), 133-139.

Coletta-Filho, H.D., M.A. Machado, M.L.P.N. Targon and J. Pompeu Jr. (2000), The use of random amplified polymorphic DNA to evaluate the genetic variability of Ponkan mandarin (Citrus reticulate Blanco) accessions. Genetic and Molecular Biology, 23(1), 169-172.

Kyndt, T., B.V. Droogenbroeck, E. Rromeijn-Peeters, J.P. Romero-Motochi. X. Scheldeman, P. Goetghebeur, P. Van Damme and G. Gheysen (2005), Molecular phylogeny and evolution of Caricaceae based on rDNA Internal Transcribed space (ITS) and chloroplast sequence data, Mol. Phy. Evol., 37, 442-459.

Nguyễn Bảo Vệ, Lê Vĩnh Thúc, Nguyễn Bá Phú, Nguyễn Việt Khởi, Nguyễn Thị Thu Đông, Phùng Thị Thanh Tâm, Lâm Ngọc Phương, Nguyễn Ngọc Tuyết, Bùi Thị Cẩm Hường, Lưu Thái Danh, Phạm Thị Phương Thảo và Phạm Đức Trí. 2007. Ứng dụng công nghệ cao trong chọn, tạo giống cam Sành (Citrus nobilis Lour) và quýt Đường (Citrus reticulata Blanco) không hột có năng suất và phẩm chất cao. Báo cáo khoa học đề tài Nghiên cứu Khoa học cấp Tỉnh. Sở Khoa học và Công nghệ Vĩnh Long. 77p.

Nhan, N.T., T. Shimizu, N. Hirohisa, M. Omura and N.M. Chau (2003), RAPD Markers: Application to Varietal Identification and Analysis of Genetic Relationships among Citrus Varieties/Species in Vietnam, Jircas Newletters.

Oliveira, R.P., C.I. Aguilar-Vildoso, M. Cristofani and M.A. Machado (2004), Skewed RAPD markers in linkage maps of Citrus, Genet. Mol. Biol, 27(3), 437-441.

Rogers, S.O. and A.J.B. Bendich (1988), Extraction of DNA from plant tissues, Plant molecular Biology Manual, Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, printed in Belgium.

Trần Thị Oanh Yến, Nguyễn Ngọc Thi, Nguyễn Nhật Trường và Phạm Ngọc Liễu (2005), Kết quả tuyển chọn giống cam mật (Citrus sinensis) không hạt ổn định trong tự nhiên, Kết quả nghiên cứu khoa học công nghệ rau quả năm 2003-2004, Viện nghiên cứu cây ăn quả Miền Nam, Nhà xuất bản Nông Nghiệp, Trang 65-76.

Pielou, E.C. (1984), The interpretation of Ecological Data, Wiley, New York

Sambrook, J., E.F. Fritsch and T. Maniatis (1989), Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY, Vol. 1, 2, 3.