Quá trình trưởng thành của MicroRNA 144 phụ thuộc vào Dicer

Lê Thị Trúc Linh * và Hồ Thị Bích Phượng

* Tác giả liên hệ (linh.ltt@ou.edu.com)

Article Sidebar

Full Text: PDF

Ngày nhận bài: 13-11-2018
Ngày nhận bài sửa: 20-03-2019
Ngày duyệt đăng: 12-04-2019
Ngày xuất bản: 12-04-2019
Title: MicroRNA 144 requires Dicer for its maturation
DOI: 10.22144/ctu.jsi.2019.003
Lượt xem
105
Downloads
158
Crossref
Scopus
Google Scholar
Europe PMC
Trích dẫn
Linh, L. T. T., & Phượng, H. T. B. (2019). Quá trình trưởng thành của MicroRNA 144 phụ thuộc vào Dicer. Tạp chí Khoa học Đại học Cần Thơ, 55(CĐ Công nghệ Sinh học), 24-28. https://doi.org/10.22144/ctu.jsi.2019.003
Số báo
Tập. 55 Số. CĐ Công nghệ Sinh học (2019)
Chuyên mục
Công nghệ sinh học

Abstract

MicroRNAs are short (~20nt to 25nt long) single – stranded RNA molecules that have emerged as important post- transcriptional regulators of gene expression. The maturation of miRNAs depends on either Dicer or Ago2. In this study, the role of Dicer in miR-144 maturation was investigated. MicroRNA 144 level in Dicer knock out cell lines was determined by real-time PCR. The results showed that miR-144 expression significantly decreased when Dicer was knocked out. This data suggests that the maturation of miR-144 is Dicer dependent.
Keywords: Ago2, Dicer, DLD, miR-144, maturation

Tóm tắt

MicroRNA (miRNA) là một nhóm RNA có kích thước từ 20 đến 25 nucleotide, có chức năng điều hòa biểu hiện gen bằng cách gắn đặc hiệu với một trình tự trên mRNA đích. Quá trình trưởng thành của các miRNAs từ tiền miRNA có thể phụ thuộc Dicer hoặc Ago2. Nghiên cứu này được thực hiện nhằm khảo sát vai trò của Dicer trong quá trình trưởng thành của miRNA 144 (miR-144). Theo đó, hàm lượng miR-144 trong tế bào bị mất Dicer sẽ được kiểm tra bằng real-time PCR. Kết quả cho thấy khi Dicer bị mất đi, lượng miR-144 trưởng thành giảm mạnh. Điều đó cho thấy quá trình trưởng thành của miR-144 phụ thuộc vào Dicer.
Từ khóa: Ago2, Dicer, DLD, miR-144, trưởng thành

Article Details

Tài liệu tham khảo

Ambros, V., 2004. The functions of animal microRNAs. Nature. 431(7006): 350-355.

Bartel, D., 2004. MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function. Cell. 116(2): 281-297.

Berezikov, E., Chung, W.J., Willis, J., Cuppen, E. and Lai, E.C. 2007. Mammalian mirtron genes. Molecular cell. 28(2): 328-336.

Cai, X., Hagedorn, C. and Cullen, B., 2004. Human microRNAs are processed from capped, polyadenylated transcripts that can also function as mRNAs. RNA (New York, N.Y.). 10(12): 1957-1966.

Carthew, R.W. and Sontheimer, E.J., 2009. Origins and mechanisms of miRNAs and siRNAs. Cell. 136(4): 642-655.

Chen, C., Ridzon, D., Broomer, A., et al., 2005. Real-time quantification of microRNAs by stem–loop RT–PCR. Nucleic Acids Research. 33(20): e179-e179.

Chendrimada, T., Gregory, R., Kumaraswamy, E., Norman, J., Cooch, N., Nishikura, K. and Shiekhattar, R., 2005. TRBP recruits the Dicer complex to Ago2 for microRNA processing and gene silencing. Nature. 436(7051): 740-744.

Dueck, A. and Meister, G., 2010. MicroRNA processing without Dicer. Genome Biol. 11(6): 123.

Han, J., Lee, Y., Yeom, K.H., Kim, Y.K., Jin, H. and Kim, N., 2004. The Drosha-DGCR8 complex in primary microRNA processing. Genes & Development. 18(24): 3016-3027.

Ketting, R.F., Fischer, S.E., Bernstein, E., Sijen, T., Hannon, G.J. and Plasterk, R.H., 2001. Dicer functions in RNA interference and in synthesis of small RNA involved in developmental timing in C. elegans. Genes & Development. 15(20): 2654-2659.

Kim, N., 2005. MicroRNA biogenesis: coordinated cropping and dicing. Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 6(5): 376-385.

Kozomara, A. and Griffiths-Jones, S., 2011. miRBase: integrating microRNA annotation and deep-sequencing data. Nucleic Acids Research. 39(Database issue): D152-D157.

Lee, Y., Ahn, C., Han, J., et al., 2003. The nuclear RNase III Drosha initiates microRNA processing. Nature. 425(6956): 415-419.

Lee, Y., Jeon, K., Lee, J.T., Kim, S. and Kim, N., 2002. MicroRNA maturation: stepwise processing and subcellular localization. The EMBO Journal. 21(17): 4663-4670.

Lee, Y., Kim, M., Han, J., Yeom, K.H., Lee, S., Baek S. and Kim, N., 2004. MicroRNA genes are transcribed by RNA polymerase II. The EMBO Journal. 23(20): 4051-4060.

Lewis, B., Burge, C. and Bartel, D., 2005. Conserved Seed Pairing, Often Flanked by Adenosines, Indicates that Thousands of Human Genes are MicroRNA Targets. Cell. 120(1): 15-20.

Lim, L., Lau, N., Garrett-Engele, P., et al., 2005. Microarray analysis shows that some microRNAs downregulate large numbers of target mRNAs. Nature. 433(7027): 769-773.

Papapetrou, E.P., Korkola, J.E. and Sadelain, M., 2010. A genetic strategy for single and combinatorial analysis of miRNA function in mammalian hematopoietic stem cells. Stem cells. 28(2): 287-296.

Rodriguez, A., Griffiths-Jones, S., Ashurst, J. and Bradley, A., 2004. Identification of mammalian microRNA host genes and transcription units. Genome Research. 14(10A): 1902-1910.

Rosenberger, C.M., Podyminogin, R.L., Diercks, A.H., et al., 2017. miR-144 attenuates the host response to influenza virus by targeting the TRAF6-IRF7 signaling axis. PLoS pathogens. 13(4): e1006305.

Ruby, J.G., Jan, C.H. and Bartel, D.P., 2007. Intronic microRNA precursors that bypass Drosha processing. Nature. 448(7149): 83.

Yi, R., Qin, Y., Macara, I. and Cullen, B., 2003. Exportin-5 mediates the nuclear export of pre-microRNAs and short hairpin RNAs. Genes & Development. 17(24): 3011-3016.