Phân lập và xác định nấm gây hại trên cây nghệ (Curcuma)

Vũ Thị Yến * , Trần Nhân Dũng và Đỗ Tấn Khang

* Tác giả liên hệ (yencan2511@gmail.com)

Article Sidebar

Full Text: PDF

Ngày nhận bài: 02-01-2018
Ngày nhận bài sửa: 15-03-2018
Ngày duyệt đăng: 29-10-2018
Ngày xuất bản: 29-10-2018
Title: Isolation and identification of pathogens and fungi on turmeric (Curcuma) medicine
DOI: 10.22144/ctu.jvn.2018.138
Lượt xem
281
Downloads
164
Crossref
Scopus
Google Scholar
Europe PMC
Trích dẫn
Yến, V. T., Dũng, T. N., & Khang, Đ. T. (2018). Phân lập và xác định nấm gây hại trên cây nghệ (Curcuma). Tạp chí Khoa học Đại học cần Thơ, 54(7), 33-40. https://doi.org/10.22144/ctu.jvn.2018.138
Số báo
Tập. 54 Số. 7 (2018)
Chuyên mục
Công nghệ sinh học

Abstract

In the purpose of finding out the fungi that caused diseases on turmeric (Curcuma) to support for storing medicine materials, the study was carried out. Seventeen strains of pathogen fungi were isolated and identified morphology characteristics from four fresh Curcuma samples named as Binh Phuoc, Xa Cu, Indonesia, Black and three dried samples of AGZG030510, AGZG010510 and DL020611. All of the isolated strains were verified as saprophytic and pathogenous fungi in plants. Fifteen of them were selected for identification by PCR (polymerase chain reaction) technique and sequencing of internal transcribed spacer (ITS) regions. The result showed that seven of them were belong to Fusarium genus: F. oxysporum, F. chlamydosporum, F. verticilliodes, 4 strains of F. proliferatum; three strains were Aspergillus genus: A. flavus, A. terreus, A. tubingensis; two Penicillium species; one was Rhizopus oryzae; one was Dichotomomyces cejpii and another was Coriolopsis polyzona. The phylogenetic tree was drawn based on their ITS sequences. R. oryzae and C. polyzona species were located on two main branches because they belong to the large fungal phylum as Zygomycetes and Basidiomycetes. The others were Ascomycetes and located on the other two branches with bootstrap value of 87%.
Keywords: Curcuma, fungi, isolation, ITS, morphology characteristics, phylogentic tree, sequencing

Tóm tắt

Đề tài được thực hiện nhằm tìm ra những dòng nấm gây hại trên củ nghệ (Curcuma) được bảo quản làm dược liệu. Quá trình phân lập và nhận diện sơ bộ thông qua đặc điểm hình thái được 17 dòng nấm gây hại từ bốn mẫu nghệ tươi là nghệ Bình Phước, nghệ Indonesia, nghệ Xà Cừ, nghệ Đen và ba mẫu nghệ khô là AGZG030510, AGZG010510, DL020611. Tất cả các dòng nấm được phân lập đều có hại trên thực vật. Mười lăm dòng nấm được tuyển chọn từ mười bảy dòng trên để tiến hành định danh bằng kỹ thuật PCR và giải trình tự vùng gene ITS. Kết quả cho thấy có bảy dòng nấm thuộc chi Fusarium gồm: F. oxysporum, F. chlamydosporum, F. verticilliodes và bốn dòng F. proliferatum; ba dòng thuộc chi Aspergillus: A. flavus, A. terreus, A. tubingensis; hai dòng thuộc chi Penicillium; một dòng Rhizopus oryzae; một dòng Dichotomomyces cejpii và một dòng Coriolopsis polyzona. Từ các dòng nấm đã định danh xác định được giản đồ phả hệ thể hiện độ tương quan di truyền giữa chúng. R. oryzae và C. polyzona thuộc hai nhánh khác vì chúng thuộc hai ngành nấm lớn là Zygomycetes và Basidiomycestes. Các loài nấm còn lại được chia làm hai nhánh có chỉ số bootstrap 87% và cùng thuộc Ascomycetes.
Từ khóa: Đặc điểm hình thái, giải trình tự, giản đồ phả hệ, ITS, nấm, nghệ, phân lập

Article Details

Tài liệu tham khảo

Arunrat, C., Runglawan,S., Tawatchai,T., Piya,M.,Nison,S.,Jintana,S., 2008. Two new species of Curcuma (Zingiberaceae) used ascobra-bite antidotes. Journal of Systematics and Evolution. 46(1): 80–88.

Aziz, N.H., Youssef,Y.A.,El-Fouly, M.Z.,Moussa,L.A.,1998. Contamination of some common medicinal plant samples and spices by fungi and their mycotoxins. Botanical Bulletin of Academia Sinica. 39: 279-285.

Burgess, L.W., Knight, T.E., Tesoriero,L., Phan,H.T., 2008. Diagnostic manual for plant diseases in Vietnam. ACIAR Monograph No. 129, 210 pages.

Đỗ Tất Lợi, 2004. Những cây thuốc và vị thuốc Việt Nam. Nhà xuất bản Y học. Hà Nội. 1294trang.

El-Fadaly, H.M., El-Kadi,S.M., Hamad,M.N., Habib,A.A., 2015. Isolation and Identification of Egyptian Ras Cheese (Romy) Contaminating Fungi during Ripening Period. Journal of Microbiology Research. 5(1): 1-10.

El-Gali, Z.I., 2014. Detection of fungi associated with some spices in original form. Global Journal of Scientific Researches. 2(3): 83-88.

Iheanacho, H.E., Njobeh, P.B., Dutton, F.M., Steenkamp, P.A., Mthombeni, J.Q., Daru, B.H.,Makun, A.H.,2014. Morphological and molecular identification of filamentous Aspergillus flavusand Aspergillus parasiticusisolated from compound feeds in South Africa. Food Microbiology. 44: 180-184.

Klich, M.A., 2002. Identification of Common AspergillusSpecies. Published by the Centraalbureau voor Schimmelcultures, Utrecht, The Netherlands. 115pages.

Korabecna, M., 2007. The variability in the fungal ribosomal DNA (ITS1, ITS2, and 5.8 S rRNA Gene): Its biological meaning and application in medical mycology. Communicating Current Research and Educational Topics and Trends in Applied Microbiology.81: 783-787.

Kwon, J-H. and Lee,C-J., 2006. Rhizopus soft rot on pear (Pyrus serotina) caused by Rhizopus stolonifer in Korea. Mycobiology. 34:151-153.

Lã Đình Mới, Trần Minh Hợi, Dương Đức Huyến, Trần Huy Thái và Ninh Khắc Bản, 2005. Tài nguyên thực vật có tinh dầu ở Việt Nam tập 1. NXB Nông nghiệp. Hà Nội, 368 trang.

Nguyễn Lê Anh Đào, 2012. Tuyển chọn các dòng nấm mốc Aspergillusspp. có khả năng phân hủy bã mía sau trồng nấm. Luận văn thạc sĩ. Trường Đại học Cần Thơ. Thành phố Cần Thơ.

Nguyễn Thị Nguyệt, 2014. Nghiên cứu công nghệ đặc chế và bảo quản dược liệu hoài sơn sau thu hoạch. Luận văn thạc sĩ. Học Viện Nông Nghiệp Việt Nam. Hà Nội.

Rawat, A., Mahajan, S., Gupta, A., Agnihotri, R.K., Wahi,N.,and Sharma, R., 2014. Detection of toxigenic fungi and mycotoxins in some stored Medicinal plant samples. International JournalofApplied Science Biotechnology.2(2): 211-216.

Roger, S. and Beasley, D., 2005. Management of plant pathogen collections. Department of Agriculture, Fisheries and Forestry, Queensland, Australia. 82 pages.

Sarathi, V., Kumar,R.S., and Panneerselvam,A., 2014. Studies on rhizome rot pathogen in Curcuma longa. International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences. 3: 296-302.

Thilagam, R., Hemalatha,N., Poongothai, E., and Kalaivani,G., 2016. Identification of Aspergillusspecies isolated from corn and peanuts in storage godowns. International Journal of Pharma and Bio Sciences. 7: 600- 606.

Trần Nhân Dũng, 2011. Sổ tay thực hành sinh học phân tử. Nhà xuất bản Đại học Cần Thơ, 175 trang.

Ülhan, S., Demürel,R., Asan,A., Bay,C., and Kinaci,E., 2005. Colonial and morphological characteristics of some microfungal species isolated from agricultural soils in Eskißehir province (Turkey). Turkey Journal of Botany. 30: 95-104.

Visagie, C.M., Houbraken,J., Frisvad,J.C., et al., 2014. Identification and nomenclature of the genus Penicillium. Studies InMycology. 78: 343–371.