Phân lập và xác định đặc tính vi khuẩn nội sinh trong rễ cây khoai lang (Ipomoea batatas) trồng trên đất phèn ở huyện Hòn Đất, tỉnh Kiên Giang

Abstract

Thirty six bacterial strains were isolated from samples of sweet potato roots in Hondat district, Kiengiang province. All isolated bacterial strains had rod shape and mobile. KL9, KL11, KL39a, KL39b endophytes with several good characteristics such as IAA biosynthesis, phosphate solubilization and fixing nitrogen were detected based on biochemical tests. KL9, KL39a, KL39b endophytes also had the ability to produce siderofores. Sequencing 16S-rDNA gene of these four endophytes indicated that KL9 had 99% identity with Burkholderia sprentiae and Burkholderia vietnamiensis, KL39a had 99% identity with Burkholderia ambifaria and Burkholderia vietnamiensis, KL39b had 99% identity with Enterobacter ludwigii and Enterobacter cloacae, KL11 had 99% identity with Klebsiella pneumoniae about 16S-rDNA gene. Interestingly, KL9, KL11, KL39a, KL39b endophytes had the best characteristics, they are suggested for biofertilizer production to apply to sweetpotato planted on sulphate soil of Hon Dat area.

Tóm tắt

Ba mươi sáu dòng vi khuẩn được phân lập trên môi trường LGI từ các mẫu rễ cây khoai lang trồng ở huyện Hòn Đất, tỉnh Kiên Giang. Tất cả các dòng vi khuẩn này đều có dạng hình que và có khả năng chuyển động. Thực hiện các phép thử sinh hóa đã xác định được các dòng KL9, KL11, KL39a, KL39b là các vi khuẩn nội sinh có đủ 3 đặc tính tốt là cố định đạm, hòa tan lân khó tan, tổng hợp IAA; Ba dòng KL9, KL39a, KL39b còn có khả năng sản xuất siderofores. Khi giải trình tự đoạn gen 16S-DNA của 4 dòng vi khuẩn này, nhận diện được dòng KL9 có tỉ lệ đồng hình của đoạn gen 16S-DNA với loài Burkholderia sprentiae và Burkholderia vietnamiensis là 99%; tỉ lệ đồng hình đoạn gen 16S-DNA của dòng KL39a với loài Burkholderia ambifaria và Burkholderia vietnamiensis là 99%; tỉ lệ đồng hình đoạn gen 16S-rDNA của dòng KL39b với loài Enterobacter ludwigii và Enterobacter cloacae là 99%; tỉ lệ đồng hình đoạn gen 16S-DNA của dòng KL11 với loài loài Klebsiella pneumoniae là 99%. Bốn dòng vi khuẩn có các đặc tính tốt này được đề nghị đưa vào sản xuất phân vi sinh cho cây khoai lang trồng trên đất phèn vùng Hòn Đất.