KHẢO SÁT SỰ LƯU HÀNH VÀ BƯỚC ĐẦU GIẢI TRÌNH TỰ GENE CỦA VIRUS CÚM GIA CẦM SUBTYPE H5N1 TẠI TỈNH CÀ MAU VÀ SÓC TRĂNG

Dương Thị Thanh Thảo * và Lý Thị Liên Khai

* Tác giả liên hệDương Thị Thanh Thảo

Article Sidebar

Full Text: PDF

Ngày nhận bài: 20-04-2021
Ngày duyệt đăng: 03-06-2022
Ngày xuất bản: 01-05-2011
Title:
Lượt xem
176
Downloads
112
Trích dẫn
Thảo, D. T. T., & Khai, L. T. L. (2011). KHẢO SÁT SỰ LƯU HÀNH VÀ BƯỚC ĐẦU GIẢI TRÌNH TỰ GENE CỦA VIRUS CÚM GIA CẦM SUBTYPE H5N1 TẠI TỈNH CÀ MAU VÀ SÓC TRĂNG. Tạp chí Khoa học Đại học Cần Thơ, (20a), 7-17. Truy vấn từ https://ctujsvn.ctu.edu.vn/index.php/ctujsvn/article/view/1090
Số báo
Số. 20a (2011)
Chuyên mục
Công nghệ

Abstract

This study was conducted to survey the Avian Influenza (AI) outbreak, virus circulation and initialized to analysis 2 gene segments such as HA (H5) and NA (N1) of AI virus (H5N1) at Ca Mau and Soc Trang provinces. They were amplified by Realtime RT-PCR and sequenced. The prevalence of AI virus, subtype H5 in Soc Trang was 1.67%, only in ducks and was not detected AI virus, subtype N1. The prevalence of AI virus, subtype H5 in Ca Mau was not detected. A total of 4 H5N1 samples at two provinces were isolated and their genome sequenced. Homology between two gene segments of 4 samples were evaluated by sequence comparision. By compairing with H5, N1 gene segments isolated in Vietnam and Asia countries, they were showed that homologous nucleotide and amino acid reached 92 ? 98% in H5 gene segment and 92 - 99% , 91 - 99%  in N1 gene segment, respectively. It was noteworthy that full-length H5, N1 gene segments were closely related to Guangdong strain which had origined from China.
Keywords: H5N1, gene

Tóm tắt

Đề tài được thực hiện nhằm khảo sát sự lưu hành của virus cúm gia cầm và bước đầu nghiên cứu trình tự gene HA (H5) và NA (N1) của một số chủng virus cúm gia cầm, subtype H5N1 tại tỉnh Cà Mau và Sóc Trăng. Bằng kỹ thuật Realtime RT-PCR đã giúp phát hiện sự lưu hành của virus cúm gia cầm và với kỹ thuật giải mã gene đã bước đầu giải mã gene các chủng virus cúm gia cầm ở tỉnh Cà Mau và Sóc Trăng. ở tỉnh Sóc Trăng có sự lưu hành của virus cúm gia cầm subtype H5 với tỷ lệ 1,67% , xảy ra chủ yếu là trên vịt, không phát hiện sự lưu hành của subtype N1. ở tỉnh Cà Mau không phát hiện  sự lưu hành của virus cúm gia cầm subtype H5N1. Kết quả giải mã gene từ 4 mẫu của chủng virus cúm gây bệnh trên gia cầm ở tỉnh Cà Mau và Sóc Trăng có mức độ tương đồng về nucleotide và amino acid  92 ? 98%  trong trình tự gene H5, và trong trình tự gene N1 có tỷ lệ tương đồng tương đối cao 92 - 99% về thành phần nucleotide, 91 - 99% về amino acid với các chủng đã phân lập ở Việt Nam trước đây và 1 số nước Châu á. Các chủng virus thu nhận được có cùng nguồn gốc phát sinh với các chủng virus cúm gia cầm thuộc phân dòng Quảng Đông, Trung Quốc.
Từ khóa: Cúm gia cầm, H5N1, gene

Article Details

Tài liệu tham khảo

Capua I., Terregino, C., Cattoli, G. Mutinelli, F. and Rodriguez, J.F. (2002), Development of a DIVA(Diferentiating Infected from Vaccinated Animals) strategy using a vaccine containing a heterologus neuramidase for the control of avian influenza. Avian Pathol 32: 47-55

Cơ quan Thú y Vùng VII (2009), Báo cáo tổng kết công tác thú y năm 2009.

Cục Thú y (2006), Tiêu chuẩn quy trình ngành Thú y, NXB Nông Nghiệp, Hà Nội.

Cục Thú y (2008), Quy trình xét nghiệm virus cúm gia cầm (phát hiện M, H5, N1) bằng phương pháp Real time RT-PCR.

Ito T., and Kawaoka Y., (1998), Avian influenza. p. 126–136. In Nicholson KG, Webster R.G, Hay A.J. Textbook of influenza. Blackwell Sciences Ltd., Oxford, United Kingdom.

Ito T., Couceiro J.N, Kelm S., Baum L.G, Krauss S., Castrucci M.R, Donatelli I., Kida H., Paulson J.C, Webster R.G, and Kawaoka Y., (1998), Molecular basis for the generation in pigs of influenza A viruses with pandemic potential. J Virol 72: 7367–7373.

Lê Thanh Hoà, Đinh Duy Kháng, Phan Văn Chi, Nông Văn Hải, Trương Nam Hải, Lê Trần Bình (2006), Nghiên cứu sinh học phân tử các chủng virus cúm A/H5N1 phân lập ở Việt Nam tại Viện Công nghệ sinh học. Hội nghị khoa học kỷ niệm 30 năm Viện Khoa học Công nghệ Việt Nam. Hà Nội, 19/5/2005, tr 75 – 82.

Murphy B.R, and Webster (1996), Orthomyxoviruses. In Fields BN, Knipe DM, Howley PM. Fields Virology, 3rd ed. Lippincott-Raven Publishers, Philadelphia, Pa: 1397-1445.

Nguyễn Bích Nga (2006), Phân lập, lưu giữ và nghiên cứu đặc tính phân tử gene HA (H5) và NA (N1) của một số chủng virus cúm A, subtype H5 trên gia cầm ở Việt Nam. Luận án Thạc sĩ khoa học Nông nghiệp. Viện khoa học và sự sống - Đại Học Thái Nguyên.

Nguyễn Tiến Dũng, Đào Thanh Vân, Bùi Ngọc Anh, Kenjiro Inui, Bùi Nghĩa Vượng, Nguyễn Thế Vinh, Nguyễn Bá Thành, Trương Thị Kim Dung (2005), Giám sát tình trạng nhiễm virus cúm gia cầm tại Đồng bằng sông Cửu Long cuối năm 2004. Tạp chí Khoa học Kỹ thuật Thú y, tập XII, số 2, trang 13-18.

Nguyễn Tiến Dũng, Malik Periris, Robert Webster, Đào Thanh Vân, Bùi Ngọc Anh, Nguyễn Thế Vinh, Kent Inui, Bùi Nghĩa Vượng, Nguyễn Viết Không, Ngô Thanh Long (2005), Nguồn gốc virus cúm gia cầm H5N1 tại Việt Nam năm 2003-2004. Tạp chí Khoa học Kỹ thuật Thú y, tập XI, số 3, trang 6-14.

Nguyễn Tiến Dũng, Nguyễn Thế Vinh, Dhanasekaran vijaykrishna, Robert G. Weber, Yi Guan, J.S Malik Peiris và Gavin J.D. Smith (2008), Sự đa dạng của các dòng virus cúm A (H5N1) tại Việt Nam từ 2005-2007. Tạp chí khoa học kỹ thuật thú y, tập XV, (4) trang 9-16.

Webster R.G, (1998), Influenza: an emerging disease. Emerg Infect Dis 4: 436–441.

WHO/GIPSN: The World Health Organization Global Influenza Program Surveillance Network (2007), Evolution of H5N1 Avian Influenza Viruses in Asia.