Huỳnh Ngọc Thanh Tâm * , Nguyễn Thị Kim Tươi Hà Thanh Toàn

* Tác giả liên hệ (hnttam@ctu.edu.vn)

Abstract

This study was performed to isolate and identify fungi associated with two cultivars of pomelo commonly growing in the Mekong Delta, Da Xanh and Nam Roi pomelo. The results show that both cultivars of pomelo demonstrated the high frequency of fungus isolate, which was seen in a total of 8 isolates. Isolated fungi were identified morphologically, microscopically using molecular standard procedures, ITS1, and ITS4. From the peel of Da Xanh pomelo, the isolated fungal genera were Aspergillus brunneoviolaceus, A. aculeatus, A. carbonarius, Neurospora intermedia. The identification by sequencing of ITS (internal transcribed spacer) gene revealed that 8 selected isolates from Nam Roi pomelo had 98 ÷ 100% identity to A. niger, A. assiutensis, A. aculeatusN. intermedia, Schizophyllum commune and Penicillium sp. The identification of fungi strains presented on pomelo peel is the first step for proposing pretreatment and post-harvest technology, helping to prolong the shelf life of fresh pomelo.

Keywords: Da Xanh pomelo, fungi, internal transcribed spacer sequences, Nam Roi pomelo, PDA

Tóm tắt

Nghiên cứu được thực hiện với mục đích phân lập và nhận diện các dòng nấm mốc hiện diện trên bề mặt hai loại bưởi thường trồng ở Đồng bằng sông Cửu Long là bưởi Da xanh và bưởi Năm Roi. Kết quả cho thấy cả hai loại bưởi đều có tần suất phân lập nấm cao, với 8 dòng nấm được tìm thấy đối với mỗi giống bưởi. Các dòng nấm phân lập được xác định đặc tính hình thái và định danh theo phương pháp sinh học phân tử, sử dụng cặp mồi ITS1 và ITS4. Từ vỏ bưởi Da Xanh, các dòng nấm phân lập được là Aspergillus brunneoviolaceus, A. aculeatus, A. carbonarius, Trichoderma asperellumNeurospora intermedia. Tương tự, việc xác định bằng giải trình tự gen trên đoạn ITS cho thấy 8 dòng phân lập được chọn lọc từ bưởi Năm Roi có mức độ đồng hình 98 ÷ 100% với A. niger, A. assiutensis, A. aculeatus, N. intermedia, Schizophyllum communePenicillium sp.  Việc nhận diện các dòng nấm có trên vỏ bưởi là bước đầu tiên để đề xuất điều kiện tiền xử lý và bảo quản sau thu hoạch phù hợp, giúp kéo dài thời gian bảo quản bưởi tươi.

Từ khóa: Bưởi Da Xanh, bưởi Năm Roi, nấm mốc, PDA, trình tự gen đoạn ITS

Article Details

Tài liệu tham khảo

Akintobi, A. O, Okonko, I. O., Agunbiade, S. O., Akano, O, R & Onianwa, O., (2011). Isolation and identification of fungi associated with the spoilage of some selected fruits in Ibadan South Western, Nigeria. Academia Arena, 3(11):1-7.

Aleme, M. & Guta, M., (2017). Isolation and characterization of fungi from the fruit of orange and tomato in Jimma town market sellers, South West Ethiopia. International Journal of Advanced Research, 5(3): 108-115.

Bray, M. R. & Clarke, A. J., (1995). The structure and function relationship of Schizophyllum commune xylanase A. Progress in Biotechnology, 10: 147-163.

Carlile, M. J., Watkinson S. C.  & Gooday, G. W., (2001). The Fungi., second edition, Academic Press.

Gladieux, P., De Bellis, F., Hann-Soden, C., Svedberg, J., Johannesson, H. & Taylor, J. W., (2020). Neurospora from natural populations: population genomics insights into the life history of a model microbial eukaryote. In: Dutheil J. (eds) Statistical Population Genomics. Methods in Molecular Biology, vol 2090. Humana, New York, NY.

Gobet, J., Zavanella, C., Hermant, N., Comninellis, C., & Ippolito, A., (2014). U.S. Patent Application No. 14/118,295.

Kwon, O. C., Ju, W. T., Kim, H. B., Sung, G. B., & Kim, Y.S., (2018). Isolation and identification of postharvest spoilage fungi from mulberry fruit in Korea. Korean Journal of Environmental Agriculture, 37(3): 221-228.

Nguyễn Văn Mười, Đỗ Thị Tuyết Nhung và Lâm Văn Mềnh (2005). Phân lập sơ bộ nấm mốc hiện diện ở cam sành sau thu hoạch và biện pháp kiểm soát chúng trong bảo quản.  Chương trình VLIR-IUC CTU- Đề án R.2 “Cây ăn trái”. Hội thảo quốc gia “Cây có múi, xoài và khóm” (trang 156 -161), NXB Nông nghiệp.

Oviasogie, F. E., Ogofure, A. G, Beshiru, A., Ode, J. N. & Omeje F. I., (2015). Assessment of fungal pathogens associated with orange spoilage. African Journal of Microbiology Research, 9(29): 1758-1763.

Rasool, A., Zaheer, I. & Iram, S., (2014). Isolation and characterization of post-harvest fungal pathogens of Citrus varieties from the domestic markets of Rawalpindi and Islamabad. International Journal of Scientific & Engineering Research, 5(10): 408-418.

Reddy, B. P. K., Uma Rajashekhar, A., Harikrishna, P. & Lavanya, A. V. N., (2017). Cultural and physiological studies on wild mushroom specimens of Schizophyllum commune and Lentinula edodes. International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences, 6(7): 2352-2357.

Shaikh, N. I. & Chavan, A. M., (2017). Isolation and characterization of Penicillium sp. from citrus.  International Journal of Current Research, 9(7): 53465-53466.

Smilanick, J.  L., Mansour, M. F., Gabler, F. M., & Goodwine, W. R., (2006). The effectiveness of pyrimethanil to inhibit germination of Penicillium digitatum and to control citrus green mold after harvest. Postharvest Biology and Technology, 42(1): 75-85.

Strano, M. C., Altieri, G., Admane, N., Genovese, F. & Di Renzo, G. C., (2017). Advance in citrus postharvest management: diseases, cold storage and quality evaluation. Citrus Pathology (Edited by Harsimran Gill), Intech Open.

Trần Thanh Trúc, (2013). Phân lập và tuyển chọn dòng nấm mốc Aspergillus niger sinh tổng hợp pectin methylesterase hoạt tính cao. Luận án tiến sĩ ngành Vi sinh vật học, Trường Đại học Cần Thơ.

Varga, J., Frisvad, J. C., Kocsubé, S., Brankovics, B., Tóth, B., Szigeti, G. & Samson, R. A., (2011). New and revisited species in Aspergillus section Nigri. Studies in Mycology, 69(1):1-17.

White, T. J., Bruns, T. D., Lee, S. & Taylor, J., (1990). Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: Innis MA, D.H. Gelfand, J. J. Sninsky, T. J. White, PCR protocols, a guide to methods and applications. San Diego, California: Academic Press. p.315-322.