Khảo sát sự đa dạng di truyền cây lêkima (Pouteria campechiana) ở thành phố Cần Thơ dựa trên đặc điểm hình thái và chỉ thị phân tử ISSR

Abstract

Lucuma (Pouteria campechiana) is a fruit plant that is rich in biologically active substances such as carotenoids. In this study, the data of 20 lucuma samples in Can Tho city were collected and evaluated based on morphological characteristics and ISSR molecular markers. 50 morphological characteristics of lucuma were analyzed. 20 lucuma samples were divided into seven groups with the similarity coefficient from 0.71 to 0.86. The Shannon index showed that 20 lucuma samples had high diversity value which the highest value peaked at 1.526. Electrophoretic analysis by 8 ISSR markers also showed the significance of polymorphism. There were 115 out of 119 bands were polymorphic with the ratio of 96.36%. Each marker amplified an average of 14.88±4.29 bands, of which 14.38±4.5 bands were polymorphic. The similarity coefficient was from 0.41 to 1.00 and able to cluster into 4 separate groups. Finally, the combined results of morphological characteristics and molecular markers analysis illustrated that total 20 samples were classified into 4 groups with high similarity ranging from 0.63 to 0.90. The overall result of this study showed that 20 lucuma samples have considerable diversity. These are valuable original information resource for lucuma selection and breeding as well as support for further studies about the biochemical characteristics of lucuma.

Tóm tắt

Cây lêkima (Pouteria campechiana) là cây ăn trái chứa nhiều chất có hoạt tính sinh học như carotenoid. Trong nghiên cứu này, dữ liệu của 20 mẫu lêkima ở thành phố Cần Thơ đã được thu thập và đánh giá dựa trên đặc điểm hình thái và chỉ thị phân tử ISSR. Phân tích 50 đặc tính hình thái của 20 mẫu lêkima và phân thành 7 nhóm với hệ số tương đồng từ 0,71 đến 0,86. Chỉ số Shannon cho thấy 20 mẫu lêkima có độ đa dạng cao với giá trị đạt cao nhất là 1,526. Phân tích điện di bằng 8 chỉ thị ISSR cho thấy sự đa hình cao. Trong 119 băng điện di ghi nhận được có 115 băng đa hình chiếm tỉ lệ 96,36%. Mỗi mồi khuếch đại trung bình 14,88±4,29 băng, trong đó 14,38±4,5 băng là đa hình. Hệ số tương đồng từ 0,41 đến 1,00 và được chia thành 4 nhóm lớn. Sự phối hợp kết quả phân tích đặc tính hình thái và chỉ thị phân tử đã phân chia 20 mẫu lêkima thành 4 nhóm có độ tương đồng cao từ 0,63 đến 0,90. Kết quả khẳng định cây lêkima ở thành phố Cần Thơ có sự đa dạng về mặt di truyền. Kết quả này cũng cung cấp thông tin có giá trị cho việc chọn lọc và lai tạo giống cũng như hỗ trợ các nghiên cứu về các đặc tính sinh hóa của cây lêkima.