NGHIÊN CỨU CẤU TẠO TUYẾN NỌC ĐỘC VÀ MÔ HÌNH HÓA CẤU TRÚC KHÔNG GIAN 3D BẬC 3 CỦA PROTEIN ĐỘC TỐ LOÀI ỐC CỐI CONUS TESSULATUS

Nguyễn Thị Anh Thư * , Phan Dũng và Đặng Thúy Bình

* Tác giả liên hệ (ntathu@nomail.com)

Article Sidebar

Full Text: PDF

Ngày nhận bài: 10-06-2014
Ngày duyệt đăng: 04-08-2014
Ngày xuất bản: 24-09-2014
Title: Researching on venom glands' composition and modeling three-dimensional structure of toxin protein in Conus tessulatus
Lượt xem
50
Downloads
37
Trích dẫn
Thư, N. T. A., Dũng, P. ., & Bình, Đ. T. (2014). NGHIÊN CỨU CẤU TẠO TUYẾN NỌC ĐỘC VÀ MÔ HÌNH HÓA CẤU TRÚC KHÔNG GIAN 3D BẬC 3 CỦA PROTEIN ĐỘC TỐ LOÀI ỐC CỐI CONUS TESSULATUS. Tạp chí Khoa học Đại học Cần Thơ, (CĐ Thủy sản), 245-251. Truy vấn từ https://ctujsvn.ctu.edu.vn/index.php/ctujsvn/article/view/1830
Số báo
Số. CĐ Thủy sản (2014)
Chuyên mục
Thủy sản

Abstract

The morphological characteristic, anatomical venom duct, structure of radular teeth, a.a sequence of toxin and three-dimensional structure of Conus tessulatus?s (vermivorous feeding mode) toxin protein in Nha Trang Bay, Khanh Hoa Province were studied. The results showed that venom buld of C. tessulatus has a sickle milky white shape, venom duct has pale yellow, radular sac has reddish, radular teeth of C. tessulatus are soft structure and small size, have serration, one bard. Results of ?-conotoxin protein sequencing were used to construct deduced a.a sequence of the toxin protein from C. tessulatus. From this a.a sequence, framework of CC-C-C specific to ?-conotoxin be determined and three dimensional of C. tessulatus? s toxin protein structure be modeled to understand the functions of ?-conotoxin from C. tessulatus based on homological proteins known in the database. This study provides a protein database for applications in the production of drugs used in the treatment for neurological diseases.
Keywords: Conus, radular teeth, venom duct, conus snail, Protein 3D structure modelling

Tóm tắt

Đặc điểm hình thái, giải phâ?u tuyến độc tố, cấu trúc răng kitin, trình tự amino acid (a.a) và cấu trúc không gian bậc 3 của protein độc tố ốc cối Conus tessulatus (loài ăn giun biển) thu tại vịnh Nha Trang, Khánh Hòa được tiến hành trong nghiên cứu này. Kết quả cho thấy loài C. tessulatus có túi độc màu trắng sữa hình lưỡi liềm, ống dẫn độc màu vàng nhạt, túi răng kitin màu cam hơi đỏ, răng kitin có cấu trúc mềm và kích thước nhỏ, có đường răng cưa, có 1 ngạnh. Kết quả giải trình tự gen độc tố ?-conotoxin được dùng để xây dựng trình tự a.a suy diễn của protein độc tố loài C. tessulatus. Dựa trên trình tự a.a thu được, khung cystenin (CC-C-C) đặc trưng cho ?-conotoxin được xác định và cấu trúc không gian 3D bậc 3 của protein độc tố được mô hình hóa nhằm tìm hiểu chức năng của ?-conotoxin C. tessulatus dựa trên các protein tương đồng đã biết trong cơ sở dữ liệu. Nghiên cứu này cung cấp dữ liệu protein phục vụ cho ứng dụng trong quá trình sản xuất thuốc điều trị bệnh liên quan đến thần kinh.
Từ khóa: Thông tin chung: Ngày nhận: 10/6/2014 Ngày chấp nhận: 04/8/2014 Title: Researching on venom glands? composition and modeling three-dimensional structure of toxin protein in Conus tessulatus Từ khóa: Conus, răng kitin, tuyến độc, Ốc cối, cấu trúc không

Article Details

Tài liệu tham khảo

Đặng Thúy Bình, Khúc Thị An, Nguyễn Thị Thúy Hà, 2012. Định danh một số loài ốc cối (Conus spp.) ở vùng biển Nam Trung Bộ Việt Nam dựa trên đặc điểm hình thái và di truyền. Tạp chí Khoa học – Công nghệ Thủy sản số 2/2012. p:37-41.

Đặng Thúy Bình, Ngô Đăng Nghĩa, and Nguyễn Lương Hiếu Hòa, 2013. Cấu tạo tuyến nọc độc và mối quan hệ với đặc điểm dinh dưỡng của ba loài ốc cối Conus striatus, Conus textile, Conus vexillum tại vùng biển Nam Trung Bộ Việt Nam. Tạp chí Nông nghiệp và Phát Triển Nông Thôn- kỳ 1-tháng 1/2013:75-80.

Annette N., Marion L.L., Emma L.M., Paul F.A., David J.A.,Norelle L.D., David J.C., and Richard J.L.,2003.Isolation, Structure, and Activity of GID, a Novel 4/7-Conotoxin with an Extended N-terminal Sequence.p: 3137–3144.

Alexei V., Finkelstein O.B., Ptitsyn, 2002. Protein Physics: A Course of Lectures. Academic press. London. p: 4.

Cunha R.L., Castilho R., Ruber L., and Zardoya R., 2005. Patterns of Cladogenesis in the Venomous Marine Gastropod Genus Conus from the Cape Verde Islands. Systematic Biology. 54. P: 634-650.

Franklin J.B., Fernando S.A., Chalke B.A., and Krishnan K.S., 2007. Radular morphology of Conus (Gastropoda: Caenogastropod: Conidae) from India. Molluscan Research. 27(3). P: 111-122.

Harvey L., Arnold B., Lawrence Z., Paul M., David B., and James D., 2007. Molecular Cell Biology 4thedition.W.H. Freeman. New York: P 438.

James J.M., 1980. Comparative morpholory of radular teeth in Conus: observations with scanning electron microscoppy. J. Mollus. Stud. 46(1): p. 116-128.

Kang T.S., Jois S.D., and Kini R.M.,2006. Solution structures of two structural isoforms of CMrVIA chi/lambda-conotoxin. Biomacromolecules. 7(8): p 2337-46.

Luo S., Dongting Z., Ben Z., Yaru Q and Yong W., 2006, Novel α-conotoxins identified by gene sequencing from cone snails native to Hainan, and their sequence diversity, J. Pept. Sci 12: 693–704.

Nguyen N. T. 2007. Recently collected shells of Vietnam. L, Informator Piceno & N.N.T. Italy, p: 63-65.

Olivera B. M., 2002. Conus venom peptides: relections from the biology of clades and species. Annual Review of Ecology and Systematics. 33. p: 25-47.

Peng C., Mingyu y., Wang Y., Shao X., Yuan D., Liu J., Hawrot E., Wang C., Chi C., 2010. A new subfamily of conotoxins belonging to the A-superfamily. Peptides., 31(11). p: 2009-2016.

Röckel D., Korn W., and Kohn A. J., 1995. Manual of the living Conidae (Vol. I: Indo- Pacific Region). Verlag Christa Hemmen, Wiesbaden, Germany.

Terlau H., and Olivera B. M., 2004. "Conus Venoms: A Rich Source of Novel Ion Channel-Targeted Peptides". Physiol Reviews. 84. p: 41-68.

http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

http://www.fr33.net/translator.php

http://molprobity.biochem.duke.edu/

http://prosite.expasy.org/