PHÂN LẬP VÀ NHẬN DIỆN CÁC DÒNG VI KHUẨN AZOSPIRILLIUM BẰNG KỸ THUẬT PCR

Nguyễn Hữu Hiệp * , Đào Thanh Hoàng , Nguyễn Khắc Minh Loan , Phạm Thị Khánh Vân và Trần Văn Chiêu

* Tác giả liên hệ (nhhiep@ctu.edu.vn)

Article Sidebar

Full Text: PDF

Ngày nhận bài: 20-04-2021
Ngày duyệt đăng: 03-06-2022
Ngày xuất bản: 01-05-2005
Title:
Lượt xem
65
Downloads
28
Trích dẫn
Hiệp, N. H., Hoàng, Đ. T., Loan, N. K. M., Vân, P. T. K., & Chiêu, T. V. (2005). PHÂN LẬP VÀ NHẬN DIỆN CÁC DÒNG VI KHUẨN AZOSPIRILLIUM BẰNG KỸ THUẬT PCR. Tạp chí Khoa học Đại học Cần Thơ, (4), 119-126. Truy vấn từ https://ctujsvn.ctu.edu.vn/index.php/ctujsvn/article/view/391
Số báo
Số. 4 (2005)
Chuyên mục
Công nghệ

Abstract

Tweenty bacterial strains isolated from roots and stem of wild rice, cultivated rice and weeds in rice field had similar characteristics to those of Azospirillum genus. Two specific primers 5?- GTA AAT CCA CCA CCT CCC -3? (forward) and 5?- TGT AGA TTT CCT GGG CCT -3? (reverse) were used to identify these strains. The results showed that 8/20 strains and the positive Azospirillum lipoferum strain had the same DNA band at the position of 400bp. Other strains did not have the same band with the control strain. Therefore, they were not belong to Azospirillum lipoferum species. Several studies need to be carried out to classify them before applying in the field.
Keywords: Azospirillum lipoferum, PCR, primer, gen nifH

Tóm tắt

20 dòng vi khuẩn phân lập được từ rễ và thân lúa hoang, lúa trồng và một số loại cỏ ở ruộng lúa có các đặc tính giống như giống Azospirillum đã được mô tả bởi các tác giả khác. Sử dụng cặp mồi chuyên biệt khuếch đại gen nifH của loài vi khuẩn Azospirillum lipoferum, Mồi xuôi: 5?- GTA AAT CCA CCA CCT CCC -3?, Mồi ngược: 5?- TGT AGA TTT CCT GGG CCT -3? để nhận diện chúng bằng kỹ thuật PCR. Kết quả cho thấy có 8/20 dòng có các băng ADN ở vị trí 400bp giống như dòng vi khuẩn đối chứng Azospirillum lipoferum. Các dòng khác không có băng ADN tương ứng chứng tỏ chúng không thuộc loài Azospirillum lipoferum. Nhiều nghiên cứu cần được tiến hành trong tương lai để xác định các loài vi khuẩn còn lại trước khi ứng dụng thực tiễn.
Từ khóa: phân lập, Azospirillum lipoferum, PCR, mồi, gen nifH

Article Details

Tài liệu tham khảo

Baldani, J.I, Caruso, L., Baldani, V.L.D., Goi, S.R. and Döbereiner, J. 1997 Recent advances in BNF with non-legume plants Soil. Biol. Biochem. 29:911-922.

Bashan, Y., Holguin,G. and de-Bashan, L. E. 2004 Azospirillum-plant relationships: physiological, molecular, agricultural, and environmental advances (1997-2003). Can. J. Microbiol. 50:521-577.

Blaha, D., Sanguin, H., Robe, P., Nalin, R., Bally, R. and Moenne-Loccoz,Y. 2000 Physical organization of phytobeneficial genes nifH and ipdC in the plant growth-promoting rhizobacterium Azospirillum lipoferum 4V(I). FEMS Microbiol. Lett. 244 (1): 157-163

Chabot, R., Antoun, H. and Cescas, M. P. 1993 Stimulation de la croissance du mais et de la laitue romaine par des microorganisms dissolvant le phosphore inorganique. Can. J. Microbiol. 39:943-947

Döbereiner, J. 1991 The genera Azospirillum and Herbaspirillum. In: The Prokaryotes. Vol. 3. Balows, A., Trüper, H.G., Dworkin, M., Harder, W. and Scheifer, K.H. (Eds.). 2nd edition. Springer-Verlag, New York.

Döbereiner, J.; Baldani, V. L. D. and Reis, V. M. 1995 Endophytic occurence of diazotrophic bacteria in non-leguminous crops. In: Azospirillum VI and related microorganisms. Fendrik, I ; M. del Gallo, J. Vanderleyden and M de Zamarocy (eds.) pp. 3-14. Springer Verlag, Berlin, Germany.

Illmer, P. and Schinner, F. 1992 Solubilization of inorganic phosphates by microorganisms isolated from forest soils. Soil. Biol. Biochem. 24:389-395.

Krieg, N.R. and Döbereiner, J. 1984 The genus Azospirillum. In: Bergey’s Manual for Systematic Bacteriology. Krieg, N.R. and Holt, J.D. (Eds.). 1st edition. The Williams and Wilkins, Baltimore.

Kundu, B. S. and Gaur, A. C. 1984 Rice response to inoculation with N2-fixing and P-solubilizing microorganisms. Plant and Soil 79:227-234.

Nguyễn Hữu Hiệp, Cao Ngọc Điệp and David F. Herridge 2002 Nitrogen Fixation of Soybean and Groundnut in the Mekong Delta, Vietnam. In: Inoculants and Nitrogen Fixation in Vietnam pp: 10-18 edited by D. F. Herridge, ACIAR Proceedings 109e at 17-18 Feb. 2001 Hanoi

Nguyễn Hữu Hiệp and Cao Ngọc Điệp 2003 Effects of rhizobial inoculation techniques and phosphate solubilized microorganisms on soybean cultivated in acid paddy soil in Mekong Delta. Procedings in workshop on Biological Nitrogen Fixation on soybean at Malaysia. Biotechnology for Sustainable Utilization of Biological Resources in the Tropics. Vol 16. Proceedings of Project Seminar in 2002 – 2003 for JSPS-NRCT/DOST/LIPI/VCC. Published by The International Center for Biotechnology, Osaka University, Osaka, Japan

Nguyễn Hữu Hiệp, Trần Văn Chiêu, Đào Thanh Hoàng và Nguyễn Khắc Minh Loan 2005 Azospirillum: vi sinh vật cố định đạm với cây không thuộc họ đậu. Tạp chí Khoa học Cần Thơ. 2: 4-6.

Nguyễn Khắc Minh Loan, 2005 Phân lập một số dòng vi khuẩn Azospirillum trên lúa. Luận văn tốt nghiệp Cử nhân ngành Công nghệ Sinh học. Đại học Cần Thơ.

Lovell, C.R., Piceno, Y.M., Quattro, J.M., and Bagwell, C.E. 2000 Molecular analysis of diazotroph diversity in the rhizoshere of the smooth cordgrass, Spartina alterniflora. Appl. Environ.Microbiol. 66 (9): 3814-3822.

Okon, Y. 1994 Azospirillum/Plant associations. CRC Press, Inc.USA

Okon, Y. and Labandera-Gonzalez, C. A. 1994 Agronomic applications of Azospirillum: an evaluation of 20 years worldwide field inoculation. Soil. Biol. Biochem. 26:1591-1601.

Omar, N., Heulin, Th.; Weinhard, P.; Alaa El-Din, M. N. and Balandreau, J. 1989 Field inoculation of rice with in vitro selected plant/growth promoting-rhizobacteria. Agronomie 9:803-808.

Sergeeva, E.; Liaimer, A. and Bergman, B. 2002 Evidence for production of the phytohormone indole-3-acetic acid by cyanobacteria. Planta 215:229-238

Sumner, M. E. 1990 Crop responses to Azospirillum inoculation. Advances in Soil Science 12:53-123.