Nghiên cứu sử dụng một số DNA barcode trong phân tích di truyền và nhận diện một số loài lan kim tuyến (Anoectochilus spp.)

Abstract

In this study, to conserve and exploid properly genetic resources of Anoectochilus and Lusidia species, nine DNA barcodess: rbcL, matK, rpoB1, rpoB2, rpoC1, rpoC2, ITS1, ITS2, ITS were used to for genetic analysis of six species of these genera.. The results showed that the amplifications of the DNA regions were different between barcodes and ranged from 50%-100%. The amplifications of region ITS1 and ITS2 100%, region ITS 83.3%, region rbcL 50%, region matK range from 66.7 – 83.3%, region rpoB and rpoC is 83.3%. Based on ITS1 and ITS2 DNA sequence, genetics analysis phylogenetic tree constructing results showed the relationship and the discrimination between and among Anoectochilus and Lusidia species. The results showing successful uses of these DNA barcodes in identifying and discriminating Anoectochilus species and their relatives can be performed successfully, then open opportunities for conservation and sustainable uses genetic resources.

Tóm tắt

Trong nghiên cứu này, nhằm mục tiêu bảo tồn, khai thác một cách hợp lý nguồn gen một số loài lan thuộc chi Anoectochilus và Lusidia, 9 vùng DNA barcode: rbcL, matK, rpoB1, rpoB2, rpoC1, rpoC2, ITS1, ITS2, ITS được sử dụng để phân tích di truyền 06 mẫu giống lan. Kết quả phân tích DNA của các mẫu giống cho tỷ lệ khuếch đại thành công từ 50-100% cho các DNA barcode khác nhau. Vùng ITS1 và ITS2 cho tỷ lệ khuếch đại đạt 100%, vùng ITS 83,3%, vùng rbcL 50%, vùng matK từ 66,7 – 83,3%, vùng rpoB và rpoC đạt 83,3%. Kết quả phân tích mối quan hệ di truyền giữa các giống dựa trên trình tự DNA của một số vùng DNA barcode như ITS1 và ITS2 cho thấy có thể phân biệt giữa các loài gần nhau. Cây phân nhóm dựa trên vùng ITS2 chia Anoectochilus và Lusidia làm 2 nhóm chính, trong nhóm Anoectochilus chia làm hai nhóm phụ thuộc hai loài Anoectochilus formosanus và Anoectochilus roxburghii. Các kết quả này có thể ứng dụng trong việc nhận diện và phân biệt các loài lan Kim tuyến và họ hàng của chúng, từ đó mở ra khả năng trong bảo tồn và khai thác bền vững nguồn gen các loài này.